根据我国最著名的药学典籍《神农本草经》和李时珍所著《本草纲目》中，灵芝的分类如下：分为赤芝、紫芝、黄芝、白芝、黑芝、青芝等六种，并记载著"可久食轻身不老延年神仙"，使灵芝自古成为中国人心目中的神仙草。　　　赤芝：气味苦平无毒，主治胸中结、益心气。一般所说的灵芝为此类的代表种，主特征是菌伞肾形，半圆形或近圆形，表面红褐色，有漆样光泽，有菌柄与菌伞同色或较深。　　　紫芝：甘温无毒，主治耳聋，利关节、益精气、坚筋骨，好颜色、疗虚劳、治痔。紫芝的特征是菌伞褐色，紫黑色至近黑色，菌肉为均匀褐色，其担孢子较一般赤芝为大，中国紫芝为此类的代表种。　　　黄芝：甘平无毒，主治心腹五邪，益脾气，安神。根据葛洪在抱朴子中所描述：肉芝分为赤、白、黑、青、黄五种，黄者如紫金，大者10余斤，小者三四斤。认为黄芝可能之一是硫黄菌，这种真菌新鲜时菌伞肉质多汁，新鲜标本常可达数斤重. 　　 白芝：辛平无毒，主治咳逆上气，益肺气，通利口鼻，强志意，安魄。抱朴子中描述白芝如"截肪"，因此苦白蹄可能为此类。这种真菌菌肉质白，如马蹄状，大者可数斤，生于松树和其他针叶树上。　　　黑芝：咸平无毒，主治癃、利水道，益肾气、通九窍，聪察。依采芝图记载，黑芝生山谷之阴，黑盖赤理，黑茎、味咸苦。根据以上记载黑芝可能是假芝和黑柄多孔菌这类具有黑色菌伞和菌柄的真菌。　　　青芝：酸平无毒，主治明目、补肝气、安精魂。抱朴子云："青者如翠羽"，认为灵芝可能是青芝的代表，此种真菌亦具革质菌盖，表面有短绒毛，因此富多样色彩变化。